В первом сезоне сериала «Пустые города» Виктор Пугачёв возвращается в свой родной город после долгого отсутствия, но его приезд не вызывает особой радости у местных жителей. Дело в том, что когда-то он стал источником эпидемии, принеся с собой опасную инфекцию. Пять лет назад Виктор вместе с товарищами по работе — Германом Латниковым, Леонидом Дорожкиным и Никитой Шаталиным — служил в оперативном отделе уголовного розыска Северонефтянска под руководством Давида Егизаряна. Однако их карьеры завершились после загадочного исчезновения значительной суммы денег из сейфа, предназначенной для хранения в качестве вещественного доказательства.

Теперь, когда город на грани карантина и преступность может вырасти до небес, Егизарян решает воссоздать свой старый отдел, надеясь на опыт своих бывших коллег. Но вскоре становится очевидным, что он не может предложить им ничего, кроме удостоверений дружинника. Ситуация накаляется, и каждый из героев сталкивается с собственными демонами, пытаясь разобраться в сложной паутине событий, которые привели их к этому моменту. Атмосфера напряженности и неопределенности пронизывает каждую серию, заставляя зрителей сопереживать персонажам и ждать развязки.